Ketoacyl-ACP Synthase III

Ketoacyl-ACP Synthase III

Camelina Protein Sequences(with an Alternative Assembly)
>contig05752 length=1022 numreads=139 QAKIAWLAQKQLPKLLKWLRLFLKILTSCALPLLMIYFGAAPQIQKALGCTKNPLAYDITAACSGFVLGLVSAACHIRGGGFKNVLVIGADSLSRFVDWTDRGTCILFGDAAGAVVVQACDIEDDGLFSFDVHSDGDGRRHLNASVKESQTDGESSSNGSVFGDFPPKQSSYSCIQMNGKEVFRFAVKCVPLSIESALQKAGLPASAIDWLLLHQANQRIIDSVATRLHFPPERVISNLANYGNTSAASIPLALDEAVRSGKVKPGHTIATSGFGAGLTWGSAIVRWRMAKVQHVSLLQSQGFLLPRGTLETWFNRSCLVRLNLEVKAHFVIRS >KA_contig27223 length=890 numreads=156 gene=isogroup05979 status=isotig SLSSFLLSFIPVMQSLALRIRAERDRKERSLIFALNQSRFVVLRFISIRMANASGFFTSPSIPNLRSRINVPIGVSRSGFCVSTRFSNRVLCSTLSSVDKDASSSPSQYQRPRLVPSGCKLIGCGSAVPSLLISNDDLAKIVDTNDEWIATRTGIRNRRVVSGKDSLVGLAVEAATKALEMAEVVPEDIDLVLMCTSTPDDLFGAAPQIQKALGCTKNPLAYDITAACSGFVLGLVSAACHIRGGGFKNVLVIGADSLSRFVDWTDRGTCILFGDAAGAVVVQACDIEDDGLFSFDVHSDGDGRRHLNASVKESQTDGESSSNGSVFGDFPPKQSSYSCIQMNGKEVFRFAVKCVPLSIESALQKAGLPASAIDWLLLHQANQRIIDSVATRLHFPPERVISNLANYGNTSAASIPLALDEAVRSGKVKPGHTIATSGFGAGLTWGSAIVRWRMTLSPTCKFTSEPRFFTPSRNTGNLVVLFGPIKPRGKSAFCLNSVSLFVESF

Camelina Nucleotide Sequence
>contig05752 length=1022 numreads=139 AGAGACCGAATTCAAACAAAaTGCGCTTTTACCTCTAGGTTTAatcGgACCAAACAAGACCTATTAAaCCAAGTTTCCAGTGTTCCTCGAGGGAGTAAAAAaCCTTGGCTCTGAAGTAAACTTACATGTTGGACTTtaGCcATTCATCTCCATCGGACAATTGCTGATCCCCACGTTAAACCGGCTCCAAAACCGgATGTGGCTATGGTATGTCCTGGTTTAaCTTTtCcGCTTCTCACTGCCTCATCAAGAGCTAGAGGAATCGAAGCAGCGCTCGTGTTACCGTAATTAGCCAAATTCGATATGACTCGCTCTGGTGGAAAATGAAGCCTTGTAGCCACAGAGTCTATTATTCTCTGGTTCGCCTGATGGAGGAGGAGCCAGTCGATGGCAGAAGCAGGAAGACCAGCTTTTTGCAaAGCAGACTCAATAGATaGAGGAACACATTTGACAGCAAAGCGAAACACCTCTTTTCCATTCATCTGAATACAAGAATATGAAGATTGTTTTGGTGGAAAGTCTCCAAACACCGAGCCATTGGAGCTTGATTCACCATCAGTTTGGGATTCTTTAACAGAaGCATTCAAATGtCTTCGACCGTCCCCATCGCTGTGCACATCAAAACTGAACAAACCATCATCTTCAATATCACAAGCCTGAACAACcACAGCACCAGCAGCGTCCCCAAATAGAaTGCAGGTCCCTCTATCCGTCCAATCAACAAACCGAGATAAAGAATCAGCTCCAATCACTAAAACATTCTTAAAACcTCCCCCCCTTATATGACAAGCAGCTGAAACTAGaCCCAAAACAAATCCACTACAAGCAGCTGTGATATCGTACGCCAATGGGTTCTTTGTGCAACCAAGTGCCTTTTGAATCTGTGGAGCAGCACCgAAAtAGATCATCAGGAGTGgAAGTGCACATCAAGACTAAGTCAATATCTTCAGGAACAACCTCAGCCATTTCAAGaGCTTTGGTaGCTGCTTCTACTGCTAAGCCAACCAAGCTATCTTTGCCTG >KA_contig27223 length=890 numreads=156 gene=isogroup05979 status=isotig AAtCtTTGtCTTCGTaAtTTCTTCTCtCAtTCATTcCGGTgaTgCAATCTCtGGCATTAcGcTAAAtTCGAGCTGAAAGAgATAGATAGaAAGaAAGATCCTTGatTTTTGCATTGAACCAATCTCGtTTcGTTGTTCTTCGaTTCATTTCAATCaGAATGGCGAATGCATCTGGGTTCTTCACTTCTCCTTCGATTCCTAACCTACGaAGCAGAATCAATGTTCCGATTGGAGTTTCTCGATCTGGGTTTTGTGTTTCGACTCGATTCTCTAACAGGGTTTTGTGCTCTACCCTCAGCTCTGTCGATAAGGATGCTTCGTCGTCTCCTTCTCAATATCAACGACCCAGGTTAGTGCCGAGTGGCTGCAAATTGATTGGATGTGGATCAGCGGTTCCAAGTCTTTTGATTTCTAATGATGATCTTGCGAAAATAGTCGATACTAATGATGAATGGATAGCTACTCGTACTGGTATTCGCAATCGTCGAGTTGtTTCAGGCAAAGATAGCTTGGTTGGCTTAGCAGTAGAAGCaGCTACCAAAGCTCTTGAAATGGCTGAGGTTGTTCCTGAAGATATTGACTTAGTCTTGATGTGCACTTCCACTCCTGATGATCTATTCGGTGCTGCGCCACAGATTCAAAAGGCACTTGGTTGCACAAAGAACCCATTGGCCTATGATATCACAGCTGCTTGTAGTGGATTTGTTTTGGGTCTAGTTTCAGCTGCTTGTCATATAAgGGGGGGAgGTTTTAAGAATGTTTTAGTGATTGGAGCTGATTCTTTATCTCGGTTTGTTGATTGGACGGATAGAGGGACCTGCATTCTATTTGGGGACGCTGCTGGTGCTGTGGTTGTTCAGGCCTGTGATATTGAAGATGATGGGTTGTTTAGTTTTGATGTGCACAGCGATGGGGACGGTCGAAGaCATTTGAATGCtTCTGTTAAAGAATCCCAAACTGATGGTGAATCAAGCTCCAATGGCTCGGTGtTTGGAGACTTTCCACCAAAACAATCTTCATATTCTTGTATTCAGATGAATGGAAAAGAGGTGTTTCGCTTTGCTGTCAAATGTGTTCCTCtATCTATTGAGTCTGCttTGCAAAAAGCTGGTCTTCCTGCTTCTGCCATCGACTGGCTCCTCCTCCATCAGGCGAACCAGAGAATAATAGACTCTGTGGCTACAAGGCTTCATTTTCCACCAGAGCGAGTCATATCGAATTTGGCTAATTACGGTAACACGAGCGCTGCTTCGATTCCTCTAGCTCTTGATGAGGCAGTGAGAAGCgGGAAAGTTAAACCAGGACATACCATAGCCACATCCGGTTTTGGAGCCGGTTTAACGTGGGGATCAGCAATTGTCCGATGGAGATGAATGaCttTAAGTCCAACATGTAAGTTTACTTCAGAGCCAAGGTTTTTTACTCCCTCGAGGAACACTGGAAACTTGGTTTAATAGGTCTTGtTTGGTCCgaTTAAACCTAgaGGTaAAAGCGCAtTTTGtTTGAATTCGGTCTCtCTTTTTGTTGaAAGTTTC

Arabidopsis Orthologous Sequences
>"3-KETOACYL-ACYL CARRIER PROTEIN SYNTHASE III - ref|NC_003070.9|:23192502-23194737 Arabidopsis thaliana chromosome 1, complete sequence ATGGCTAATGCATCTGGGTTCTTCACTCATCCTTCAATTCCTAACTTGCGAAGCAGAATCCATGTTCCGGTTAGAGTTTCTGGATCTGGGTTTTGCGTTTCCAATCGATTCTCTAAGAGGGTTTTGTGCTCTAGCGTCAGCTCCGTCGATAAGGATGCTTCGTCTTCTCCTTCTCAATATCAACGACCCAGGTGAATAAAAATCACATTTTTATGTCTCTCTTCACTTATCCATTGATTTGAGATTCTGAGATTAGGAAGATTGATTATTGTTTTAAGTCTTTAGCCTTAACTCTGTGAAAGATCTTAAATTTGCTTTTGGAATGCATTTGATTACTCTTTAGCTTAGCTTTAAGATGATCTTTAAGCCAAAGTTATCACAAGTTTAGCTTTTGAAGAATGTGTCTTTGATTTATGATTCCTTTGGTTCTGTTTACTTAAAGGCTAGTGCCGAGTGGCTGCAAATTGATTGGATGTGGATCAGCAGTTCCAAGTCTTCTGATTTCTAATGATGATCTCGCTAAAATAGTTGATACTAATGATGAATGGATTGCTACTCGTACTGGTATTCGCAACCGTCGAGTTGTCTCAGGTAACATATAACATTTGATTAGTTCCGCTATGTTAAGCTAAGAGTATCAGGTAGAGAGATTAATTTGTAAAACTATAATTGAAGGCAAAGATAGCTTGGTTGGCTTAGCAGTAGAAGCAGCAACCAAAGCTCTTGAAATGGCTGAGGTTGTTCCTGAAGATATTGACTTAGTCTTGATGTGTACTTCCACTCCTGATGATCTATTTGGTGCTGCTCCACAGGTATTTATTGACCCTTAATTCTAAAATTTCTCTTCGGTGGAGTAAGATTTCCCGTTGTTTGATTCGCGATAACTGTCTATTGATGGCAGATTCAAAAGGCACTTGGTTGCACAAAGAACCCATTGGCTTATGATATCACAGCTGCTTGTAGTGGATTTGTTTTGGGTCTAGTTTCAGCTGCTTGTCATATAAGGGGTAAAAGTCAAATAAGATTCAAATTCGAATAAGTAATGAATAAGTTAAGTGTATAGTTCTTGTCCCTTTCTGTTTTTTCAGGAGGCGGTTTTAAGAACGTTTTAGTGATCGGAGCTGATTCTTTGTCTCGGTTTGTTGATTGGACGGATAGAGGGACTTGCATTCTATTTGGAGATGCTGCTGGTGCTGTGGTTGTTCAGGTACTGTGCCTTATGAAGCTTTTGAGCAATTTCGTGCACTTATATCCAAAGTTTGTATACATAAGCTTCATTGAAAGAGTATAACCTTTAGTAAATTATTACAAGTAACACAATCATAAGACGAGTGCTTGCCACAGTGCATATCAAAAGATCAATCTTTGTTTATTAACGAAATGTCCTTTCATTTCGTGCAGGCTTGTGATATTGAAGATGATGGTTTGTTCAGTTTTGATGTGCACAGCGATGGGGATGGTCGAAGGTATTTGATTCACATTTCAGTTTTTTGGCCTCTTAAGATCCATCTTCTCATTTCTTTCCCTCAAGAACCCACAGTAAGAGTCTGTTTTTGCAGACATTTGAATGCTTCTGTTAAAGAATCCCAAAACGATGGTGAATCAAGCTCCAATGGCTCGGTGTTTGGAGACTTTCCACCAAAACAATCTTCATATTCTTGTATTCAGATGAATGGAAAAGAGGTCTTTCGCTTTGCTGTCAAATGTGTTCCTCAATCTATTGAATCTGCTTTACAAAAAGCTGGTCTTCCTGCTTCTGCCATCGACTGGCTCCTCCTCCACCAGGTTATTTTCTTATCAGAATTTTATCGTTAATTCAAGTTGCGTTGATAGTAGATATGAATTCAAGCTTAAATGGGGGAAAGTTTAGAGCTTTCGTATGTCGATAAGTATACTCATCATTTCTTCAGTTTCCATTGATAATGGACTTGAAATTCGAGTTGAAATGGCGAAAGTTTTAAACTTTTGTACTGGAAAAATGGTTAAACGGATAGTTTTTGAAATATATTTGCAGGCGAACCAGAGAATAATAGACTCTGTGGCTACAAGGCTGCATTTCCCACCAGAGAGAGTCATATCGAATTTGGCTAATTATGGTAACACGAGCGCTGCTTCGATTCCGCTGGCTCTTGATGAGGCAGTGAGAAGCGGAAAAGTTAAACCAGGACATACCATAGCGACATCCGGTTTTGGAGCCGGTTTAACGTGGGGATCAGCAATTATGCGATGGAGGTGA >gi|15221522|ref|NP_176452.1| KAS III (3-KETOACYL-ACYL CARRIER PROTEIN SYNTHASE III); 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase/ catalytic/ transferase, transferring acyl groups other than amino-acyl groups [Arabidopsis thaliana] MANASGFFTHPSIPNLRSRIHVPVRVSGSGFCVSNRFSKRVLCSSVSSVDKDASSSPSQYQRPRLVPSGCKLIGCGSAVPSLLISNDDLAKIVDTNDEWIATRTGIRNRRVVSGKDSLVGLAVEAATKALEMAEVVPEDIDLVLMCTSTPDDLFGAAPQIQKALGCTKNPLAYDITAACSGFVLGLVSAACHIRGGGFKNVLVIGADSLSRFVDWTDRGTCILFGDAAGAVVVQACDIEDDGLFSFDVHSDGDGRRHLNASVKESQNDGESSSNGSVFGDFPPKQSSYSCIQMNGKEVFRFAVKCVPQSIESALQKAGLPASAIDWLLLHQANQRIIDSVATRLHFPPERVISNLANYGNTSAASIPLALDEAVRSGKVKPGHTIATSGFGAGLTWGSAIMRWR

Matching Arabidopsis Sequences from Arabidopsis Lipid Metabolism Website
(Open Reading Frame and Gene)

>At1g62640-Gene ATGGCTAATGCATCTGGGTTCTTCACTCATCCTTCAATTCCTAACTTGCGAAGCAGAATCCATGTTCCGGTTAGAGTTTCTGGATCTGGGTTTTGCGTTTCCAATCGATTCTCTAAGAGGGTTTTGTGCTCTAGCGTCAGCTCCGTCGATAAGGATGCTTCGTCTTCTCCTTCTCAATATCAACGACCCAGGTGAATAAAAATCACATTTTTATGTCTCTCTTCACTTATCCATTGATTTGAGATTCTGAGATTAGGAAGATTGATTATTGTTTTAAGTCTTTAGCCTTAACTCTGTGAAAGATCTTAAATTTGCTTTTGGAATGCATTTGATTACTCTTTAGCTTAGCTTTAAGATGATCTTTAAGCCAAAGTTATCACAAGTTTAGCTTTTGAAGAATGTGTCTTTGATTTATGATTCCTTTGGTTCTGTTTACTTAAAGGCTAGTGCCGAGTGGCTGCAAATTGATTGGATGTGGATCAGCAGTTCCAAGTCTTCTGATTTCTAATGATGATCTCGCTAAAATAGTTGATACTAATGATGAATGGATTGCTACTCGTACTGGTATTCGCAACCGTCGAGTTGTCTCAGGTAACATATAACATTTGATTAGTTCCGCTATGTTAAGCTAAGAGTATCAGGTAGAGAGATTAATTTGTAAAACTATAATTGAAGGCAAAGATAGCTTGGTTGGCTTAGCAGTAGAAGCAGCAACCAAAGCTCTTGAAATGGCTGAGGTTGTTCCTGAAGATATTGACTTAGTCTTGATGTGTACTTCCACTCCTGATGATCTATTTGGTGCTGCTCCACAGGTATTTATTGACCCTTAATTCTAAAATTTCTCTTCGGTGGAGTAAGATTTCCCGTTGTTTGATTCGCGATAACTGTCTATTGATGGCAGATTCAAAAGGCACTTGGTTGCACAAAGAACCCATTGGCTTATGATATCACAGCTGCTTGTAGTGGATTTGTTTTGGGTCTAGTTTCAGCTGCTTGTCATATAAGGGGTAAAAGTCAAATAAGATTCAAATTCGAATAAGTAATGAATAAGTTAAGTGTATAGTTCTTGTCCCTTTCTGTTTTTTCAGGAGGCGGTTTTAAGAACGTTTTAGTGATCGGAGCTGATTCTTTGTCTCGGTTTGTTGATTGGACGGATAGAGGGACTTGCATTCTATTTGGAGATGCTGCTGGTGCTGTGGTTGTTCAGGTACTGTGCCTTATGAAGCTTTTGAGCAATTTCGTGCACTTATATCCAAAGTTTGTATACATAAGCTTCATTGAAAGAGTATAACCTTTAGTAAATTATTACAAGTAACACAATCATAAGACGAGTGCTTGCCACAGTGCATATCAAAAGATCAATCTTTGTTTATTAACGAAATGTCCTTTCATTTCGTGCAGGCTTGTGATATTGAAGATGATGGTTTGTTCAGTTTTGATGTGCACAGCGATGGGGATGGTCGAAGGTATTTGATTCACATTTCAGTTTTTTGGCCTCTTAAGATCCATCTTCTCATTTCTTTCCCTCAAGAACCCACAGTAAGAGTCTGTTTTTGCAGACATTTGAATGCTTCTGTTAAAGAATCCCAAAACGATGGTGAATCAAGCTCCAATGGCTCGGTGTTTGGAGACTTTCCACCAAAACAATCTTCATATTCTTGTATTCAGATGAATGGAAAAGAGGTCTTTCGCTTTGCTGTCAAATGTGTTCCTCAATCTATTGAATCTGCTTTACAAAAAGCTGGTCTTCCTGCTTCTGCCATCGACTGGCTCCTCCTCCACCAGGTTATTTTCTTATCAGAATTTTATCGTTAATTCAAGTTGCGTTGATAGTAGATATGAATTCAAGCTTAAATGGGGGAAAGTTTAGAGCTTTCGTATGTCGATAAGTATACTCATCATTTCTTCAGTTTCCATTGATAATGGACTTGAAATTCGAGTTGAAATGGCGAAAGTTTTAAACTTTTGTACTGGAAAAATGGTTAAACGGATAGTTTTTGAAATATATTTGCAGGCGAACCAGAGAATAATAGACTCTGTGGCTACAAGGCTGCATTTCCCACCAGAGAGAGTCATATCGAATTTGGCTAATTATGGTAACACGAGCGCTGCTTCGATTCCGCTGGCTCTTGATGAGGCAGTGAGAAGCGGAAAAGTTAAACCAGGACATACCATAGCGACATCCGGTTTTGGAGCCGGTTTAACGTGGGGATCAGCAAT>contig05752 length=1022 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>At1g62640-ORF1 ATGGCTAATGCATCTGGGTTCTTCACTCATCCTTCAATTCCTAACTTGCGAAGCAGAATCCATGTTCCGGTTAGAGTTTCTGGATCTGGGTTTTGCGTTTCCAATCGATTCTCTAAGAGGGTTTTGTGCTCTAGCGTCAGCTCCGTCGATAAGGATGCTTCGTCTTCTCCTTCTCAATATCAACGACCCAGGCTAGTGCCGAGTGGCTGCAAATTGATTGGATGTGGATCAGCAGTTCCAAGTCTTCTGATTTCTAATGATGATCTCGCTAAAATAGTTGATACTAATGATGAATGGATTGCTACTCGTACTGGTATTCGCAACCGTCGAGTTGTCTCAGGCAAAGATAGCTTGGTTGGCTTAGCAGTAGAAGCAGCAACCAAAGCTCTTGAAATGGCTGAGGTTGTTCCTGAAGATATTGACTTAGTCTTGATGTGTACTTCCACTCCTGATGATCTATTTGGTGCTGCTCCACAGATTCAAAAGGCACTTGGTTGCACAAAGAACCCATTGGCTTATGATATCACAGCTGCTTGTAGTGGATTTGTTTTGGGTCTAGTTTCAGCTGCTTGTCATATAAGGGGAGGCGGTTTTAAGAACGTTTTAGTGATCGGAGCTGATTCTTTGTCTCGGTTTGTTGATTGGACGGATAGAGGGACTTGCATTCTATTTGGAGATGCTGCTGGTGCTGTGGTTGTTCAGGCTTGTGATATTGAAGATGATGGTTTGTTCAGTTTTGATGTGCACAGCGATGGGGATGGTCGAAGGTATTTGATTCACATTTCAGTTTTTTGGCCTCTTAAGATCCATCTTCTCATTTCTTTCCCTCAAGAACCCACAGTAAGAGTCTGTTTTTGCAGACATTTGAATGCTTCTGTTAAAGAATCCCAAAACGAGGGTGAATCAAGCTCCAATGGCTCGGTGTTTGGAGACTTTCCACCAAAACAATCTTCATATTCTTGTATTCAGATGAATGGAAAAGAGGTCTTTCGCTTTGCTGTCAAATGTGTTCCTCAATCTATTGAATCTGCTTTACAAAAAGCTGGTCTTCCTGCTTCTGCCATCGACTGGCTCCTCCTCCACCAGGCGAACCAGAGAATAATAGACTCTGTGGCTACAAGGCTGCATTTCCCACCAGAGAGAATCATATCGAATTTGGCTAATTATGGTAACACGAGCGCTGCTTCGATTCCGCTGGCTCTTGATGAAGCAGTGAGAAACGGAAAAGTTAAACCAGGACATACCATAGCGACATCCGGTTTTGGAGCCGGTTTAACGTGGGGATCAGCAATTATGCGATGGAGGTGA >At1g62640-ORF2 ATGGCTAATGCATCTGGGTTCTTCACTCATCCTTCAATTCCTAACTTGCGAAGCAGAATC CATGTTCCGGTTAGAGTTTCTGGATCTGGGTTTTGCGTTTCCAATCGATTCTCTAAGAGGGTTTTGTGCTCTAGCGTCAGCTCCGTCGATAAGGATGCTTCGTCTTCTCCTTCTCAATATCAACGACCCAGGCTAGTGCCGAGTGGCTGCAAATTGATTGGATGTGGATCAGCAGTTCCAAGTCTTCTGATTTCTAATGATGATCTCGCTAAAATAGTTGATACTAATGATGAATGGATTGCTACTCGTACTGGTATTCGCAACCGTCGAGTTGTCTCAGGCAAAGATAGCTTGGTTGGCTTAGCAGTAGAAGCAGCAACCAAAGCTCTTGAAATGGCTGAGGTTGTTCCTGAAGATATTGACTTAGTCTTGATGTGTACTTCCACTCCTGATGATCTATTTGGTGCTGCTCCACAGATTCAAAAGGCACTTGGTTGCACAAAGAACCCATTGGCTTATGATATCACAGCTGCTTGTAGTGGATTTGTTTTGGGTCTAGTTTCAGCTGCTTGTCATATAAGGGGAGGCGGTTTTAAGAACGTTTTAGTGATCGGAGCTGATTCTTTGTCTCGGTTTGTTGATTGGACGGATAGAGGGACTTGCATTCTATTTGGAGATGCTGCTGGTGCTGTGGTTGTTCAGGCTTGTGATATTGAAGATGATGGTTTGTTCAGTTTTGATGTGCACAGCGATGGGGATGGTCGAAGACATTTGAATGCTTCTGTTAAAGAATCCCAAAACGATGGTGAATCAAGCTCCAATGGCTCGGTGTTTGGAGACTTTCCACCAAAACAATCTTCATATTCTTGTATTCAGATGAATGGAAAAGAGGTCTTTCGCTTTGCTGTCAAATGTGTTCCTCAATCTATTGAATCTGCTTTACAAAAAGCTGGTCTTCCTGCTTCTGCCATCGACTGGCTCCTCCTCCACCAGGCGAACCAGAGAATAATAGACTCTGTGGCTACAAGGCTGCATTTCCCACCAGAGAGAGTCATATCGAATTTGGCTAATTATGGTAACACGAGCGCTGCTTCGATTCCGCTGGCTCTTGATGAGGCAGTGAGAAGCGGAAAAGTTAAACCAGGACATACCATAGCGACATCCGGTTTTGGAGCCGGTTTAACGTGGGGATCAGCAATTATGCGATGGAGGTGA

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last updated by Jason Macrander 6/8/2010